Do kompetencji zespołu do spraw ochrony zdrowia zwierząt Powiatowego Inspektoratu Weterynarii w Suwałkach należy w szczególności:
- zwalczanie chorób zakaźnych zwierząt, w tym chorób odzwierzęcych, podlegających obowiązkowi zwalczania,
- monitoring chorób zakaźnych zwierząt,
- monitorowanie chorób odzwierzęcych i odzwierzęcych czynników chorobotwórczych,
- przeprowadzanie kontroli weterynaryjnej w handlu i wywozie zwierząt oraz produktów w rozumieniu przepisów o kontroli weterynaryjnej w handlu,
- zdrowiem zwierząt przeznaczonych do rozrodu oraz jakością zdrowotną materiału biologicznego, jaj wylęgowych drobiu i produktów akwakultury,
- przestrzeganiem przepisów o ochronie zwierząt,
- przestrzeganiem zasad identyfikacji i rejestracji zwierząt oraz przemieszczaniem zwierząt, kontrola wymogów wzajemnej zgodności,
- przestrzeganiem wymagań weterynaryjnych w gospodarstwach utrzymujących zwierzęta gospodarskie, dobrostan zwierząt,
- nadzór nad środkami transportu zwierząt, ich zatwierdzanie i kontrola dobrostanu zwierząt podczas transportu,
- nadzór nad schroniskami dla zwierząt, fermami zwierząt futerkowych, miejscami gromadzenia, spędami, targowiskami, wystawami,
- nadzór nad fermami drobiu - rzeźne, hodowlane, konsumpcyjne,
- prowadzenie czynności administracyjnych związanych z obowiązkiem zgłoszenia zwierząt do uboju gospodarczego,
- monitorowanie choroby Aujeszkyego oraz innych chorób dla których opracowano krajowe lub lokalne programy zwalczania,
- utrzymaniem, hodowlą, prowadzeniem ewidencji zwierząt doświadczalnych w jednostkach doświadczalnych, hodowlanych i u dostawców,
- wymianą informacji w ramach weterynaryjnych systemów wymiany informacji,
- innymi zadaniami nałożonymi przepisami prawa.